索菲亚跑丢的位置跟农场近，只能是在丛林里跑了最后难逃被咬，所以娃娃掉在溪流里。

奥蒂斯本来就常出去找附近丧尸带回来关进谷仓，他先找到索菲亚的可能性最大，应该是被他在溪流里找到了带回去，所以娃娃仍然留在溪流里。同时奥蒂斯一出场就出去找药品救卡尔，所以才没机会说出自己曾经找到过索菲亚，所以才让他们继续找了好几集。农场主肯定知道奥蒂斯带索菲亚回来，完全可以让瑞克去认认看是不是，毕竟离事发地点很近又同是小女孩。可惜农场主不愿意暴露自己收留丧尸的秘密。不过也应该是因为怕瑞克他们伤心，才没告诉他们索菲亚已经被感染了。应该是2个原因，一怕暴露秘密，二怕他们伤心。

可能是肖恩被行尸困在大巴士里时，他割破手放血吸引行尸来舔，舔干后他又用手在那个位置涂抹，就这样病菌进入了体内（或者瑞克刺杀的他的刀上沾有病菌），但他并没有变成行尸。

原因很有可能是除了被行尸抓伤或咬伤会过几个小时变成行尸外，其他原因造成感染了病菌，病菌都会在人体内潜伏，一旦人死了，病菌立即发挥作用，人复活变成行尸（兰德尔在挣脱手铐时，手上弄出了伤口，而手铐是从两个死行尸警察身上拿的，上面可能带有病毒，就这样被感染了，在被肖恩杀死后变成了行尸，拿箭的那个人没在他身上发现抓伤或咬伤）。

不知道楼主有没发现？使用弓箭的那个人，在寻找索菲亚的时候掉下山，被自己 的箭刺伤，他的箭以前射杀过行尸，射杀后他都只是用布擦拭下又继续用，那样的话他的箭上一定带有病毒，他被刺伤后一直都没变行尸，我猜想他如果死了（如果没被爆头），会活过来变成行尸。